Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATCO43716 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATCO43716 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATCO43716 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GATCO43716 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATCO43716 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATCO43716 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATCO43716 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATCO43716 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms