Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNAB3O43448 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNAB3O43448 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms