Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFIT3O14879 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFIT3O14879 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms