Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F3O00716 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F3O00716 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F3O00716 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F3O00716 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F3O00716 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F3O00716 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E2F3O00716 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms