Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQV1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQV1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQV1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BQV1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BQV1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQV1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BQV1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms