Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GOLGA8SH3BPF8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GOLGA8SH3BPF8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms