Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf229H3BNL8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms