Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRDCB7Z8K6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRDCB7Z8K6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms