Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM1B2RUZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms