Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms