Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMTNL1A8MU46 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMTNL1A8MU46 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms