Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM4A7MD48 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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