Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC69A6NI79 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC69A6NI79 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms