Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HMX3A6NHT5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms