Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRCP1A6NGW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRCP1A6NGW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms