Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF316A6NFI3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms