Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALM3A6NDB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms