Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms