Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSDA5PKW4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSDA5PKW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms