Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms