Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMD3A2A2Y4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD3A2A2Y4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms