Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms