Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEB3A0JP26 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms