Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 BTN3A2-209ENST00000527422 1460 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CCR1-201ENST00000296140 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DDX50P2-201ENST00000463545 2193 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AJ003147.3-201ENST00000622989 2199 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 KANK1-206ENST00000382303 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MROH5-205ENST00000621837 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 OR2Z1-201ENST00000324060 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP150-201ENST00000362969 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MRO-202ENST00000398439 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 FAHD2CP-201ENST00000427863 900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC079355.2-201ENST00000440057 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MED27-204ENST00000474263 762 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CTNNA2-214ENST00000496558 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC114744.1-201ENST00000498116 666 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC067904.1-201ENST00000522530 1225 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PGA4-202ENST00000537932 840 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL110504.1-201ENST00000557733 889 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DDX11L9-202ENST00000560040 573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MTND6P22-201ENST00000604233 521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC117503.5-201ENST00000623681 549 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 WASH5P-209ENST00000633742 173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 DERL2-201ENST00000158771 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 INSC-203ENST00000424273 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ATXN8OSP0DMR3 PAK6-201ENST00000260404 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 FMO1-202ENST00000367750 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CCDC149-202ENST00000389609 2127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NT5C1B-RDH14-202ENST00000532967 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC083805.1-201ENST00000499481 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CCDC36-204ENST00000452691 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ITGA7-206ENST00000553804 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC011815.1-201ENST00000586922 4382 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF738-201ENST00000311015 2442 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 OR10K1-204ENST00000641460 1965 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 KLF7-203ENST00000421199 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 YPEL5-203ENST00000379520 2560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SEL1L-201ENST00000336735 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 WDR83OS-201ENST00000222190 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 C22orf15-201ENST00000305199 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MIRLET7E-201ENST00000362102 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 U3.21-201ENST00000391019 220 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DMKN-205ENST00000414866 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC108114.1-201ENST00000477321 437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms