Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ERVV-1-201ENST00000602168 2202 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP19-7Q3SYF9 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms