Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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