Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 HCG20-208ENST00000439406 1202 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ANKRD40Q6AI12 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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