Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf54-201ENST00000314014 887 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4L1-201ENST00000315683 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731537.1-201ENST00000343087 421 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR13D3P-201ENST00000412501 937 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF85-208ENST00000597314 563 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355989.2-201ENST00000603304 512 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067904.3-201ENST00000617126 261 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H4L-201ENST00000618305 312 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPP-204ENST00000618653 570 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL17A-206ENST00000622488 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606490.2-201ENST00000457562 1330 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms