Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
E2F1Q01094 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
E2F1Q01094 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms