Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LINC01103-201ENST00000430551 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RTL8BQ17RB0 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms