Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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HOXD12P35452 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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HOXD12P35452 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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HOXD12P35452 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD12P35452 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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