Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF880-201ENST00000344085 496 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074033.1-201ENST00000418623 410 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB4BP2-201ENST00000454125 798 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002812.5-201ENST00000530972 712 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN1R13P-201ENST00000406212 885 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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