Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 EDRF1-AS1-202ENST00000593871 592 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC01484-203ENST00000521128 2361 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 MEIS1-212ENST00000495021 2836 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRHP20396 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 ANTXRLP1-201ENST00000604933 1829 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 SOX13-210ENST00000618875 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 DOCK8-202ENST00000382331 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 CD22-205ENST00000544992 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AP003354.1-201ENST00000523791 533 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 AP006296.1-201ENST00000537438 499 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC037198.1-201ENST00000560769 281 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 TRIM16L-201ENST00000395671 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRHP20396 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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TRHP20396 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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TRHP20396 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 IGSF1-201ENST00000361420 4378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF195-204ENST00000354599 2970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 WEE2-AS1-206ENST00000478332 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRHP20396 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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