Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C3P1-202ENST00000497718 4954 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 U91328.2-201ENST00000606723 4130 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTGS1-203ENST00000373698 4987 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PSPC1P1-201ENST00000442352 665 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GPD2-202ENST00000409125 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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