Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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