Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GAPDHP73-201ENST00000423411 1007 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC011472.3-201ENST00000586051 906 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PDCD1Q15116 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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