Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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