Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD10P28358 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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HOXD10P28358 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
HOXD10P28358 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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