Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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RTL8BQ17RB0 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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