Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A4Q9Y6R1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A4Q9Y6R1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms