Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms