Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUBP2Q9Y5Y2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms