Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLF2Q9Y5W3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms