Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC4Q9Y296 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAPPC4Q9Y296 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms