Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FARSAQ9Y285 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FARSAQ9Y285 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms