Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPSEQ9Y251 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms