Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTF2Q9UNY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms