Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
INO80Q9ULG1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
INO80Q9ULG1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms