Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms