Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBE1Q9UJT0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms